主角-長峰智希（ながみね ともき）是風見坂学園的2年级生。
由于父母长期在海外工作的原因，而寄住在了两小无猜深菜川夕陽（みながわ ゆうひ）的家里。
平时过着安稳的校园生活，放学后的闲暇时间要么就在图书委员会工作，要么就在夕陽家经营的咖啡店“夕顔亭”中帮忙，这也成为了每日的必修课。然后某日。
智希暗恋的前辈兼图书会委员长綾瀬紗雪（あやせ さゆき）向其引荐了一本书，于是智希来到了坐落于商业街边的旧书店“風鈴堂”。
果真如智希所料，和冷清的店面一样，店内也是潮气扑鼻，脏乎乎的书架上放着满是污垢的书。
虽然是如此，然而就算现在就调头离开的话，心境也决不会好转，于是开始寻觅本人所需的那本书。在到处观望之时，无意中发现了一本书。
这是一本书背上写着“your diary”字样的旧书。智希不可思议地被这本书所吸引，顺手拿起，慢慢翻开了封面――
随着爆发出的柔和光芒，一个女孩子随之蹦出……“你是ゆあ的新朋友吗？”
随着和这个自封为神的名为ゆあ的匪夷所思少女的邂逅，智希身边三个女孩子本已停止的命运之轮又开始转动了……
伴随着这空白的日记本――